Tokyo, 1983. Un jeune homme en compagnie au volant de sa coccinelle essaye d'échapper aux policiers qui le poursuivent en pleine tempête. Afin d'éviter d'écraser un ouvrier, le jeune homme fait une manœuvre qui propulse sa voiture hors d'un pont, tout droit dans la direction de l'œil du cyclone. Mais un fait étrange se produit et l'œil du cyclone devient un passage temporel.
Et le jeune homme se réveille à Néo-Tokyo en l'an 2050 !

Seulement, il a complètement perdu la mémoire et il se retrouve pourchassé à la fois par la police et par une organisation criminelle, Néga, dont le chef suprême général Mégalon semble le vouloir coûte que coûte pour une opération nommée l'opération 3891.
Le jeune homme, rebaptisé Super Durand, devient flic dans la police mobile 38, en compagnie de Claude, un jeune policier avec qui il est rentré en collision en arrivant dans le futur. En plus de tout cela Sophia, une jeune religieuse, se joindra au groupe pour lutter contre Néga et aussi pour tenter d'éclaircir le mystère Super Durand. Qui est-il ? Pourquoi général Mégalon le veux-il à tout prix ?